文献速递OXA型碳青霉烯酶在

知名权威白癜风专家 https://wapyyk.39.net/bj/zhuanke/89ac7.html

题:法国产OXA-型大肠埃希菌的出现和多克隆传播(作者:EmeraudC等)

OXA是OXA-48的单一氨基酸变体,是欧洲多个国家的新兴碳青霉烯酶变体。OXA-主要存在于大肠埃希菌分离株中。目前研究报道,blaOXA-基因仅在一种类型的转座子Tn中,基于21.9-kbIS1R的复合转座子,包括截短的Tn.2(ΔTn.2)和携带blaOXA-48的IncL型质粒片段。

先前的研究仅分析了在欧洲国家传播的产OXA-的ST38型大肠埃希菌流行性克隆,且数量有限。需要更多关于OXA-的流行病学和遗传学数据以便了解其在欧洲的传播。该研究使用全基因组测序(WGS)来表征-年在法国流行的产OXA-型大肠埃希菌(OXA--E.coli)的流行病学特征。

到年,法国国家参考中心收集了97株OXA--E.coli,对其进行全基因组测序,共有12种不同的序列类型(ST);最普遍的5个是ST38(n=37)、ST(n=17)、ST69(n=12)、ST(n=11)和ST10(n=8)。在OXA--E.coli中,ST38型克隆的流行率从年的12%上升到年的47%。

三代测序结果显示,blaOXA-基因定位在染色体上。检测到8种blaOXA-不同的遗传环境。在97株大肠埃希菌分离株中,37株(38.1%)的blaOXA-位于先前报道的Tn中。在其他60株(61.9%)分离株中,blaOXA-位于较短形式的Tn。blaOXA-基因仍然位于截短的Tn.2内。对于44.3%的分离株,残余Tn的大小显著减小(G和H),blaOXA-基因包含在ΔTn.2中,其中lysR基因被IS1R元件截断。在属于被截断的遗传环境G的42个分离株中,32个(76.1%)属于ST38,并多分离自-年期间。

总结起来,自年,OXA--E.coli在法国的报道日益增多。该研究发现其多元化的克隆型,最常见的是ST38型。通过长读测序证明blaOXA-位于染色体上,在全长或者截断的Tn内。

预览时标签不可点收录于话题#个上一篇下一篇


转载请注明:http://www.heiqumeijun.com/qbbl/9477.html


当前时间: